Organizate ca o colectie aparte , fondurile de harti si atlase numara 552 de atlase, 16.606 harti, 3786 planuri de mosii, 250 harti murale, harti in relief si planigloburi. Avand un caracter national prin excelenta, colectia contine material cartografic referitor la provinciile romanesti ex.: Mappa Specialis Walachiae de 1788; Harta Moldovei, desenata de Rhigas Velestinli, 1792; Harta Principatelor Unite, 1860-1865, sau alte harti ale Romaniei intocmite de geografi celebri precum Schmidt, Konrad, Bieltz, Mercator.
Materialul cartografic, foarte variat, este de o valoare incontestabila pentru studiul istoriei nationale. Printre piesele reprezentative se afla atlasul lui Ortelius
, sau harti straine, opere ale unor geografi celebri ca Homann, Seutter, Kepert, Delisle sau Sanson.
Eveniment crucial al istoriei Romaniei, reintregirea tarii in 1918 este marcata de harta care cuprinde toate provinciile romanesti in interiorulul aceleasi entitati statale, asa cum a fost ea recunoscuta in urma Tratatului de la Trianon,
